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年创新实验学院照“生物科学类（国家生命科学与技术人才培养基地班）”、“环境科学与工程类（卓越班）”、“水利类（卓越班）”、“机械类（卓越班）”、“工商管理类（卓越班）”五个大类在高考提前批次中招生。各培养大类涉及专业如下：
培养大类
涉及专业
生物科学类（国家生命科学与技术人才培养基地班）
生物技术、生物科学、生物工程、农学、植物保护、园艺、林学、草业科学、动物科学、动物医学
环境科学与工程类（卓越班）
水土保持与荒漠化防治、资源环境科学
水利类（卓越班）
农业水利工程、水文与水资源工程、
机械类（卓越班）
机械电子工程、机械设计制造及其自动化、农业机械化及其自动化、车辆工程
工商管理类（卓越班）
工商管理、会计学、农林经济管理、土地资源管理、市场营销
实行“2+X”培养模式：学生第一、二学年按学科大类实施学科通识教育。从第三学年开始进入专业学院学习，按照多元化的人才培养模式，在导师指导下开展专业能力和个性化培养。实行本研贯通培养机制：基地班、卓越班学生实行本研贯通培养，实施分流考核制度。分流形式包括专业分流、学业分流和选拔分流三种。
专业分流是指学生按照录取的学科大类选定本科专业，时间在第一学年第二学期进行，按照分流专业指标数、学生专业志愿和综合成绩排名，最终确定学生专业。
学业分流时间在第一学年末和第二学年末分别进行，是对学生综合表现和学业状况的两次考核。符合考核要求的学生继续留在基地班或卓越班学习，不符合要求的学生不再纳入基地班或卓越班管理，须转入相关专业学院对应专业学习。
选拔分流时间在第三学年末进行，根据学生综合考核结果分别按照本研贯通培养通道和本科培养通道两种类型进行分类培养。达到考核条件并进入校内本研贯通培养的学生在第四学年提前修读研究生课程，并享受卓越农林人才优秀奖学金。
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